کنفرانس گفت‌وگوی درون اسلامی با صدور بیانیه پایانی به کار خود پایان داد و بر اهمیت وحدت اسلامی و تعامل سازنده برای مقابله با چالش‌های مشترک تأکید کرد. شرکت‌کنندگان از حمایت‌های اعلیحضرت پادشاه حمد بن عیسی آل خلیفه و میزبانی بحرین قدردانی کردند. همچنین از حضور و مشارکت ارزشمند حضرت دکتر احمد الطیب، امام اعظم الازهر شریف و رئیس شورای حکمای مسلمانان، و نیز از شورای عالی امور اسلامی به دلیل مهمان‌نوازی و سازمان‌دهی این رویداد تشکر به عمل آمد.
بیانیه پایانی تصریح کرد که وحدت اسلامی یک مسئولیت مشترک است و درک متقابل و همکاری برای تقویت اخوت اسلامی ضروری است. این بیانیه بر ضرورت گفت‌وگویی تأکید کرد که نه بر مناظره‌های الهیاتی، بلکه بر تعامل عملی برای بهره‌گیری از عناصر مشترک وحدت در مواجهه با چالش‌های معاصر متمرکز باشد.
شرکت‌کنندگان بر لزوم همکاری نهادهای دینی، علمی، فکری و رسانه‌ای برای مقابله با نفرت‌پراکنی و تحریکات فرقه‌ای تأکید کردند. بیانیه پایانی هرگونه توهین و ناسزاگویی را محکوم کرد و خواستار اتخاذ موضعی قاطع علیه هرگونه ابراز خصومت از سوی تمامی فرقه‌ها شد. همچنین تأکید شد که گفتمان تاریخی و فکری در سنت‌های مختلف اسلامی دارای خطاهای تفسیری است که باید به‌طور نقادانه مورد بازنگری قرار گیرد. این بیانیه از علما خواست تا با ارزیابی مجدد، مسیر اصلاح و تکامل معرفت اسلامی را که توسط علمای پیشین آغاز شده است، ادامه دهند.
کنفرانس بر لزوم تلاش‌های جمعی برای رسیدگی به مسائل اساسی امت اسلامی، از جمله حمایت از فلسطین، مقاومت در برابر اشغالگری، و مقابله با فقر و افراط‌گرایی تأکید کرد. شرکت‌کنندگان خاطرنشان کردند که وقتی مسلمانان از فرقه‌های مختلف در راستای این مسائل حیاتی همکاری کنند، اختلافات فرقه‌ای به‌طور طبیعی کاهش می‌یابد و همبستگی اسلامی، چنان که در قرآن کریم سفارش شده است، تقویت می‌شود.
شرکت‌کنندگان از نهادهای برجسته اسلامی خواستند تا یک مطالعه جامع در خصوص نقاط اشتراک در «عقیده»، «شریعت» و ارزش‌های اسلامی تهیه کنند. ایشان تصریح کردند که چنین اقدامی باعث افزایش خودآگاهی در جوامع مسلمان، بهبود تصورات متقابل و تقویت فرهنگ مشترک اسلامی و تعامل انسانی خواهد شد.
این بیانیه بر ضرورت نهادینه‌سازی وحدت اسلامی از طریق آموزش، خطبه‌ها و گفتمان دینی تأکید کرد. همچنین بر تدابیر عملی مانند تدوین برنامه‌های درسی که اخلاق اختلاف را آموزش دهند، ایجاد پلتفرم‌هایی برای مقابله با نفرت‌پراکنی و اجرای پروژه‌های مشترک اجتماعی و توسعه‌ای اشاره شد.
این کنفرانس بر نقش زنان در تقویت وحدت، هم در سطح خانواده و هم از طریق فعالیت‌های آموزشی و اجتماعی تأکید کرد. همچنین خواستار رویکردی نوین در گفت‌وگوی درون اسلامی شد که دیدگاه‌های جوانان و ابزارهای ارتباطی مدرن را در بر گیرد و تضمینی باشد تا گفتمان دینی با واقعیات عصر دیجیتال و آرمان‌های نسل جوان مسلمان در جهان در حال تکامل امروز، هماهنگ باشد.
شرکت‌کنندگان پیشنهاد تشکیل کمیته‌های ویژه در نهادهای اسلامی برجسته را ارائه کردند تا زمینه گفت‌وگو میان جوانان مسلمان از مذاهب مختلف را فراهم کنند. این ابتکار با هدف سازمان‌دهی برنامه‌های جوان‌محور، ارتباط دادن مسلمانان جوان در غرب با میراث اسلامی خود و ارائه تصویری مثبت از هویت دینی آن‌ها، ضمن پرداختن به برداشت های نادرست فرقه ای طراحی شده است. همچنین در این کنفرانس بر اهمیت اقدامات علمی و نهادی برای رفع سوءبرداشت‌ها، کاهش تنش‌ها و مقابله با اسلام‌هراسی به‌عنوان راهی برای بهبود تصویر جهانی مسلمانان و تقویت وحدت امت اسلامی تأکید شد.
کنفرانس پیشنهاد ایجاد یک «انجمن گفت‌وگوی اسلامی» تحت نظر شورای حکمای مسلمانان را مطرح کرد که بستری برای ارتباطات باز میان تمامی بخش‌های امت اسلامی بدون تبعیض باشد. این ابتکار از سنت پیامبر (ص) الهام گرفته است که امت اسلامی را به‌عنوان یک واحد یکپارچه معرفی می‌کند.
همچنین، بیانیه‌ای تحت عنوان «نداء أهل القبلة» (دعوت اهل قبله) صادر شد که خواهان وحدت در گفتمان دینی تحت شعار «یک ملت، یک سرنوشت مشترک» است.
دبیرخانه عمومی شورای حکمای مسلمانان اعلام کرد که یک کمیته مشترک برای گفت‌وگوی اسلامی تشکیل خواهد داد تا اجرای مصوبات کنفرانس را تضمین کند. همچنین تأیید شد که، بر اساس اعلام امام اعظم الازهر، دکتر احمد الطیب، در جریان این کنفرانس، هماهنگی‌ها برای برگزاری دومین کنفرانس گفت‌وگوی درون اسلامی با همکاری الازهر شریف، در قاهره آغاز خواهد شد.
